คุณคือ Hierarch Artanis ผู้นำของเผ่าพันธุ์ protoss ที่ยิ่งใหญ่ หลายปีก่อน โลกบ้านเกิดของคุณ Aiur ตกเป็นของฝูง zerg ที่ไร้ความปราณี ตอนนี้ ในที่สุดคุณได้ยกกองยานรบอันทรงพลังที่รู้จักกันในชื่อ Golden Armada และพร้อมที่จะทวงคืนโลกของคุณ แต่มีความชั่วร้ายโบราณ—Amon—คุกคามชะตากรรมนี้และชะตากรรมของทั้งกาแล็กซี มีเพียงคุณเท่านั้นที่สามารถรวมกลุ่ม protoss และเอาชนะความมืดที่กำลังมาถึงก่อนที่มันจะกลืนกินทุกชีวิตในภาคส่วนนี้ได้